清华大学自动化系（以下简称：自动化系）的一级学科为“控制科学与工程”，下设“控制理论与控制工程”、“模式识别与智能系统”、“系统工程”、“检测技术与自动装置”、“导航、制导与控制”、“企业信息化系统与工程”、“生物信息学”七个二级学科。研究生按二级学科招生按一级学科培养。高年级本科生根据自己的需要自主选修相关学科方向的专业课程。

       自动化系现有教师118人，其中：中国科学院院士1人(李衍达教授)，中国工程院院士1人(吴澄教授)，教育部长江特聘教授1人（管晓宏教授），教授、研究员35人，副教授、副研究员和高级工程师54人，形成了一支老中青相结合的朝气蓬勃的教学、科研队伍。同时，自动化系还聘请了著名控制科学家、中国科学院院士、前国务委员、国家科委主任、中

国工程院院长宋健，著名控制理论学家郭雷研究员，著名模式识别学家马颂德研究员等担任兼职教授。国际著名控制科学家、美国工程院院士、中国科学院和中国工程院两院外籍院士、美国哈佛大学何毓琦教授，国际著名自动控制与机器人学家、美国华盛顿大学谈自忠教授等受聘分别担任自动化系讲席教授和客座教授。到2003年为止CONTROL ENGINEERING China版权所有，自动化系已授予博士学位235人控制工程网版权所有，硕士学位1447人，4217名本科生。在校博士230余人，在校硕士生760余人。在校本科743人。

       自动化系具有强大的科学研究实力。国家CIMS工程技术研究中心、智能技术与系统国家重点实验室（分室）、生物信息学教育部重点实验室、智能交通系统联合实验室等多个国家、省部级工程中心及实验室先后建立在自动化系，在控制理论，复杂制造系统建模与调度优化，系统仿真与虚拟制造，网络化制造www.cechina.cn，现代物流与电子商务，管理与决策系统，网络化系统的建模、分析、优化，复杂系统的描述与控制，生物信息学，信息处理，模式识别，人工智能及机器人，运动体的精密制导、导航与控制，过程控制，系统工程，电子技术，检测技术，运动控制与电力电子技术，网络信息安全等多个方向开展研究工作。自1987年以来，自动化系先后承担了数百项国家级科研项目,达国际先进水平的55项，属国内首创的36项www.cechina.cn，获国家三大奖的有12项，获省部级奖42项，获国内外专利25项。其中，地球物理信号处理与识别方法及其应用、关于ARMA模型辨识与谐波恢复的研究等项目获得国家自然科学四等奖，自适应和专家系统相结合的高炉铁水含硅量预报系统、CIMS实验技术系统、加速产品创新的虚拟产品开发与系统集成技术分获国家科技进步二等奖，新型热水热量指示积算仪项目获国家发明三等奖，2000年中国经济结构的定量分析项目获国家科技进步一等奖。列入国家863计划七个高科技项目之一的CIMS实验工程，已通过国家鉴定和验收并于1994年荣获美国制造工程师学会(SME)颁发的国际大奖—"大学领先奖"，为我国CIMS研究与应用作出了重大贡献。

       自动化系非常重视基础研究和应用基础研究，近3年来，在核心期刊和国际会议上发表论文1535篇,收入SCI、EI检索刊物409篇。出版了《信息、控制与系统》系列教材，其它教材与专著共123部，其中获国家级奖10部，部级一等奖18部,二等奖6部，省级奖2部。

       为了实现清华大学创建世界一流大学的目标，建设一流的师资队伍尤为关键。在学校基金会的支持下，清华大学自动化系于2001年成立智能与网络化系统研究中心（CFINS），从世界范围聘请何毓琦、陆宝森、曹希仁、龚维博、严厚民、管晓宏共六位教授，组成哈佛大学何毓琦教授为首的“何毓琦讲席教授组”，在自动化系开展教学、科研和人才培养工作。中心主任由教育部长江特聘教授、自动化系现任主任管晓宏教授担任，何毓琦教授与宋健教授担任首席科学家。中心的宗旨是利用系统方法和信息技术，为复杂网络化系统的创新性研究提供良好的研究环境和氛围。中心重点研究复杂网络化系统理论、供需链网络与电子商务、网络信息安全以及传感器网络、通信网络、电力网络等网络化系统的安全性与经济性等问题。

       自动化系非常重视课程建设www.cechina.cn，校级和校系共建的各类精品课程达28门。本系十分注重课